[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای نویسندگان::
برای داوران::
ثبت نام و اشتراک::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
بایگانی مقالات زیر چاپ::
فهرست داوران همکار::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
ISSN
شاپای آنلاین: ISSN 2676-7309
شاپای چاپی: ISSN 2383-1367
..




 
..
:: دوره 6، شماره 2 - ( 1398 ) ::
جلد 6 شماره 2 صفحات 32-21 برگشت به فهرست نسخه ها
مقایسه توالی پیشبر ژن‌ های کنترل گل‌دهی، FT1 و سه نسخه از ژن VIN3 در ژنوتیپ‌ های چغندرقند حساس و مقاوم به بولتینگ
آزاده سوری ، اصغر میرزائی اصل* ، لیلا خدائی ، محمدرضا عبداللهی
گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا همدان ، a.mirzaie@basu.ac.ir
چکیده:   (11264 مشاهده)
کشت پاییزه چغندر‏قند به‏ عنوان کشت مناسب در کشاورزی پایدار به‏ شمار می‏ رود. ساقه ‏روی چغندرقند در سال اول کشت (بولتینگ) پدیده نامطلوبی است که موجب کاهش عملکرد چغندرقند می‏ شود و مهم‏ترین عامل محدود‏کننده در کشت پاییزه است. شناسایی و مقایسه توالی ژن ‏های گلدهی در ژنوتیپ‏ های مختلف می‏ تواند به درک کنترل مولکولی بولتینگ کمک کند. در پژوهش‏ های پیشین، مشخص شده است که میزان بیان ژن‏ های FT1 و VIN3 در چغندرقند با صفت مقاومت به بولتینگ در ارتباط است. در این تحقیق، توالی پیشبر ژن FT1 و توالی پیشبر سه نسخه از ژن VIN3 مربوط به گیاه چغندرقند، در سه ژنوتیپ مقاوم به بولتینگ و سه ژنوتیپ حساس به بولتینگ مورد مقایسه قرار گرفت. طراحی آغازگر‏های مربوط به هر ژن با استفاده از توالی ‏های DNA موجود در پایگاه NCBI انجام شد. از گیاهان کشت شده در گلدان، نمونه ‏های برگی تهیه و DNA آن‏ها استخراج شد و به‏ عنوان الگو در واکنش PCR مورد استفاده قرار گرفت. قطعات تکثیر شده، در حدود 1000 جفت‌باز برای هر پیشبر ژن، در ژنوتیپ ‏های حساس و مقاوم به بولتینگ که از نظر طول توالی پیشبر مشابه بودند، برای بررسی دقیق‏ تر توالی‏ یابی شدند. در پیشبر ژن FT1 جهشی شناسایی نشد اما، در پیشبر سه نسخه از ژن VIN3 تعداد 624 جهش از نوع جهش جایگزینی و جهش حذف و اضافه مشاهده شد. در پیشبر ژن VIN3-like1، ناحیه حذف و اضافه‏ای به طول 228 جفت‌باز شناسایی شد. این ناحیه عناصر پیشبر داشته و به‌نظر می‏رسد عملکرد کنترلی دارد. مقایسه جهش ‏های شناسایی شده بین ژنوتیپ‏ های حساس و مقاوم الگوی متمایزی برای صفت بولتینگ نشان نداد.
واژه‌های کلیدی: بولتینگ، پیشبر، جهش، چغندرقند، FT1، VIN3
متن کامل [PDF 881 kb]   (1388 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک مولکولی
پذیرش: 1398/10/29
فهرست منابع
1. Abou-Elwafa, S. F., Buttner, B., Chia, T., Schulze-Buxloh, G. Hohmann, U. Mutasa-Gottgens, E., Jung, C. and Muller, A. E. (2011). Conservation and divergence of autonomous pathway genes in the flowering regulatory network of Beta vulgaris. J Exp Bot, 62: 3359-3374. [DOI:10.1093/jxb/erq321]
2. Alimirzaee, M., M, Mirzaie-asl, A., Abdollahi, M.R. and Ebrahimi Koolai, H. (2015). The of mRNA sequence polymorphism of flowering key genes in bolting sensitive and tolerant sugar beet genotypes. Journal of Biotechnology,Computational Biology and Bionanotechnology, 98(3):209-217. [DOI:10.5114/bta.2017.70799]
3. Bastow, R., Mylne, J. S., Lister, C., Lippman, Z., Martienssen, R. A. and Dean, C. (2004). Vernalization requires epigenetic silencing of FLC by histone methylation". Nature, 427: 164-167. [DOI:10.1038/nature02269]
4. Blázquez, M., Koornneef, M. and Putterill, J. (2001). Flowering on time: genes that regulate the floral transition. EMBO reports, 2(12): 1078-1082. [DOI:10.1093/embo-reports/kve254]
5. Boudry P., Mccombie H. and Van Dijk H. (2002). Vernalization requirement of wild beet Beta vulgaris ssp maritima: among population variation and its adaptive significance. Journal of Ecology, 90, 693-703. [DOI:10.1046/j.1365-2745.2002.00704.x]
6. Ding, L., Kim, S. Y. and Michaels, S. D. (2013). FLOWERING LOCUS C EXPRESSOR family proteins regulate FLOWERING LOCUS C expression in both winter-annual and rapid-cycling Arabidopsis. Plant physiology, 163: 243-252. [DOI:10.1104/pp.113.223958]
7. FAO. (2012). FAOSTAT. http://faostat.fao.org. Accessed 10 January 2014.
8. Greb, T., Mylne, J. S., Crevillen, P., Geraldo, N., An, H., Gendall, A. R. and Dean, C. (2007). The PHD finger protein VRN5 functions in the epigenetic silencing of Arabidopsis FLC. Current biology, 17: 73-78. [DOI:10.1016/j.cub.2006.11.052]
9. Hami, M. (2016). Comparison expression of photoperiod pathway Key Gene in susceptible and resistant genotypes for Bolting in Sugar Beet. Master's Thesis. Faculty of Agriculture, Bu Ali Sina University, Hamadan (In Persian).
10. Hamzaei, A. (2016). Comparison Expression of Vernalization Pathway Key Gene in susceptible and resistant genotypes for Bolting in Sugar Beet. Master's Thesis. Faculty of Agriculture, Bu Ali Sina University, Hamadan (In Persian).
11. Hébrard, C., Trap-Gentil, M.-V., Lafon-Placette, C., Delaunay, A., Joseph, C., Lefèbvre, M., Barnes, S. and Maury, S. (2013). Identification of differentially methylated regions during vernalization revealed a role for RNA methyltransferases in bolting. Journal of experimental botany, 64: 651-663. [DOI:10.1093/jxb/ers363]
12. Helliwell, C. A., Wood, C. C., Robertson, M., James Peacock, W. and Dennis, E. S. (2006). The Arabidopsis FLC protein interacts directly in vivo with SOC1 and FT chromatin and is part of a high‐molecular‐weight protein complex. The Plant Journal, 46: 183-192.
13. Henderson, I. R. and Dean, C. (2004). Control of Arabidopsis flowering: the chill before the bloom. Development, 131(16): 3829-3838. [DOI:10.1242/dev.01294]
14. Johanson, U., West, J., Lister, C., Michaels, S., Amasino, R. and Dean, C. (2000). Molecular analysis of FRIGIDA, a major determinant of natural variation in Arabidopsis flowering time. Science, 290: 344-347. [DOI:10.1126/science.290.5490.344]
15. Jung, C. and Müller, A. E. (2009). Flowering time control and applications in plant breeding. Trends in plant science, 14: 563-573. [DOI:10.1016/j.tplants.2009.07.005]
16. Kardailsky, I., Shukla, V. K., Ahn, J. H., Dagenais, N., Christensen, S. K., Nguyen, J. T., Chory, J., Harrison, M. J. and Weigel, D. (1999) Activation tagging of the floral inducer FT. Science, 286: 1962-1965. [DOI:10.1126/science.286.5446.1962]
17. Kim, H. J., Hyun, Y., Park, J. Y., Park, M. J., Park, M. K., Kim, M. D. and Kim, J. (2004). A genetic link between cold responses and flowering time through FVE in Arabidopsis thaliana. Nature genetics 36(2): 167-171. [DOI:10.1038/ng1298]
18. Kim, D.-H., Doyle, M.R., Sung, S. and Amasino, R.M. (2009) "Vernalization: winter and the timing of flowering in plants". Annual Review of Cell and Developmental 25: 277-299. [DOI:10.1146/annurev.cellbio.042308.113411]
19. Kobayashi, Y., Kaya, H., Goto, K., Iwabuchi, M. and Araki, T. (1999) "A pair of related genes with antagonistic roles in mediating flowering signals". Science 286: 1960-1962. [DOI:10.1126/science.286.5446.1960]
20. Koornneef, M., Hanhart, C. and Van der Veen, J. (1991). A genetic and physiological analysis of late flowering mutants in Arabidopsis thaliana. Molecular and General Genetics, 229: 57-66. [DOI:10.1007/BF00264213]
21. Mellor, J. (2006). It takes a PHD to read the histone code. Cell, [DOI:10.1016/j.cell.2006.06.028]
22. 126: 22-24.
23. Michaels, S. D. and Amasino, R. M. (1999). FLOWERING LOCUS C encodes a novel MADS domain protein that acts as a repressor of flowering. The Plant Cell Online, 11: 949-956. [DOI:10.1105/tpc.11.5.949]
24. Michaels, S. D. and Amasino, R. M. (2001). Loss of FLOWERING LOCUS C activity eliminates the late-flowering phenotype of FRIGIDA and autonomous pathway mutations but not responsiveness to vernalization. The Plant Cell Online, 13: 935-941. [DOI:10.1105/tpc.13.4.935]
25. Searle, I. He, Y., Turck, F., Vincent, C., Fornara, F., Kröber, S., Amasino, R. A. and Coupland, G. (2006). The transcription factor FLC confers a flowering response to vernalization by repressing meristem competence and systemic signaling in Arabidopsis. Genes & Development, 20: 898-912. [DOI:10.1101/gad.373506]
26. Sheldon, C. C., Burn, J. E., Perez, P. P., Metzger, J., Edwards, J. A., Peacock, W. J., Dennis, E. S. (1999). The FLF MADS box gene: a repressor of flowering in Arabidopsis regulated by vernalization and methylation. The Plant Cell, 11(3): 445-458. [DOI:10.1105/tpc.11.3.445]
27. Shojaei, E, Mirzaei-asl A, Mahmoudi, S.B, Nazeri, S. (2017). Identification of sugar beet flowering genes based on Arabidopsis Homologus genes. Journal of Agricultural Science and Technology, 19(3): 719-729.
28. Strange, A., Li, P., Lister, C., Anderson, J., Warthmann, N., Shindo, C., Irwin, J., Nordborg, M. and Dean, C. (2011). Major-effect alleles at relatively few loci underlie distinct vernalization and flowering variation in Arabidopsis accessions. PLoS One, 6: e19949. [DOI:10.1371/journal.pone.0019949]
29. Sung, S. and Amasino, R. M. (2004). Vernalization in Arabidopsis thaliana is mediated by the PHD finger protein VIN3. Nature, 427(6970): 159-164. [DOI:10.1038/nature02195]
30. Sung, S., He, Y., Eshoo, T. W., Tamada, Y., Johnson, L., Nakahigashi, K., Goto, K., Jacobsen, S. E. and Amasino, R. M. (2006). Epigenetic maintenance of the vernalized state in Arabidopsis thaliana requires LIKE HETEROCHROMATIN PROTEIN 1. Nature genetics, 38: 706-710. [DOI:10.1038/ng1795]
31. Sung, S., Schmitz, R. J. and Amasino, R. M. (2006). A PHD finger protein involved in both the vernalization and photoperiod pathways in Arabidopsis". Genes & development 20: 3244-3248. [DOI:10.1101/gad.1493306]
32. Takada, S. and Goto, K. (2003). TERMINAL FLOWER2, an Arabidopsis homolog of HETEROCHROMATIN PROTEIN1, counteracts the activation of FLOWERING LOCUS T by CONSTANS in the vascular tissues of leaves to regulate flowering time. The Plant Cell, 15(12): 2856-2865. [DOI:10.1105/tpc.016345]
33. Wood, C. C., Robertson, M., Tanner, G., Peacock, W. J., Dennis, E. S. and Helliwell, C. A. (2006). The Arabidopsis thaliana vernalization response requires a polycomb-like protein complex that also includes VERNALIZATION INSENSITIVE 3. Proceedings of the National Academy of Sciences, 103: 14631-14636. [DOI:10.1073/pnas.0606385103]
34. Zilberman, D., Gehring, M., Tran, R. K., Ballinger, T. and Henikoff, S. (2007). Genome-wide analysis of Arabidopsis thaliana DNA methylation uncovers an interdependence between methylation and transcription. Nature genetics, 39(1): 61-69. [DOI:10.1038/ng1929]
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Souri A, Mirzaie-asl A, Khodaei L, Abdollahi M R. Comparison of Promoter Sequences of Flowering Control Genes, FT1 and Three Versions of VIN3, in Susceptible and Resistant Sugar Beet Genotypes to Bolting. pgr 2020; 6 (2) :21-32
URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-171-fa.html

سوری آزاده، میرزائی اصل اصغر، خدائی لیلا، عبداللهی محمدرضا. مقایسه توالی پیشبر ژن‌ های کنترل گل‌دهی، FT1 و سه نسخه از ژن VIN3 در ژنوتیپ‌ های چغندرقند حساس و مقاوم به بولتینگ. پژوهش های ژنتیک گیاهی. 1398; 6 (2) :21-32

URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-171-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 6، شماره 2 - ( 1398 ) برگشت به فهرست نسخه ها
پژوهش های ژنتیک گیاهی Plant Genetic Researches
Persian site map - English site map - Created in 0.07 seconds with 40 queries by YEKTAWEB 4642