[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای نویسندگان::
برای داوران::
ثبت نام و اشتراک::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
بایگانی مقالات زیر چاپ::
فهرست داوران همکار::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
ISSN
شاپای آنلاین: ISSN 2676-7309
شاپای چاپی: ISSN 2383-1367
..




 
..
:: دوره 6، شماره 2 - ( 1398 ) ::
جلد 6 شماره 2 صفحات 54-43 برگشت به فهرست نسخه ها
ارزیابی تنوع ژنتیکی برخی از ژنوتیپ‌های انجیر با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD و ISSR
بتول قیطرانی ، جواد عرفانی مقدم* ، آرش فاضلی
گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام ، j.erfani@ilam.ac.ir
چکیده:   (12514 مشاهده)
انجیر (.LFicus carica ) یکی از مهم­ترین گونه­ های میوه، متعلق به خانواده موراسه (Moraceae) است و به‌طور گسترده­ ای در ایران گسترش یافته است. در این مطالعه، تنوع ژنتیکی برخی از ژنوتیپ‌های انجیر که از شش منطقه مختلف استان ایلام جمع‌آوری شده بودند بر اساس نشانگرهای RAPD و ISSR بررسی شد. در مجموع 73 و 29 آلل به ترتیب از 14 آغازگر RAPD (با اندازه‌ 350 تا 2500 جفت ­باز) و 5 آغازگر ISSR (با اندازه‌ 150 تا 2500 جفت ­باز) به دست آمد. تعداد آلل‌های مشاهده شده برای آغازگرهای RAPD از 1 (OPA-03) تا 9 (OPA-09 و UBC-429) با میانگین 5.21 آلل در هر مکان به‌دست آمد. هم‌چنین تعداد آلل‌های مشاهده شده برای آغازگر ISSR از 3 (UBC-807) تا 8 (UBC-810 و UBC-414) با میانگین 5.8 آلل در مکان ثبت شد. بیشترین و کمترین مقدار شاخص شانون (I) به‌ترتیب متعلق به آغازگرهای UBC-429 (2.18) و OPA-03 (0.12) بود. ضریب همبستگی ژنتیکی جاکارد در بین ژنوتیپ‌ها بر اساس داده‌های RAPD از 0.12 تا 0.73 و برای داده‌های ISSR از 0.07 تا 1 ثبت شد. تجزیه خوشه­ ای با روش UPGMA بر اساس داده­ های نشانگرهای RAPD و ISSR، ژنوتیپ ­ها را در فاصله ژنتیکی 0.45، به شش گروه اصلی تقسیم کرد. نتایج کلی نشان داد تنوع ژنتیکی بالایی در بین ژنوتیپ‌های انجیر وجود دارد که در طبقه‌بندی، استفاده از منابع ژنتیکی و برنامه‌های به‌نژادی انجیر اهمیت دارد.
واژه‌های کلیدی: آلل، تنوع ژنتیکی، ضریب همبستگی، منابع ژنتیکی
متن کامل [PDF 700 kb]   (1662 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک مولکولی
پذیرش: 1398/6/8
فهرست منابع
1. Aalami, A. and Karami, N. (2016). The study of genetic diversity in Iranian rice cultivars using ISSR, IRAP and REMAP markers. Journal of Crop Breeding, 8: 41-51 (In Persian).
2. Ali-Shtayeh, M.S., Jamous, R.M., Zaitoun, S.Y.A., Mallah, O.B. and Mubaslat, A.K. (2014). Genetic diversity of the palestinian fig (Ficus carica L.) collection by pomological traits and RAPD markers. American Journal of Plant Sciences, 5: 1139-1155. [DOI:10.4236/ajps.2014.59127]
3. Baziar, G., Shahsavar, A.R. and Jafari, M. (2013). Evaluation of genetic diversity on fig (Ficus carica caprificus L.) in Fars province using morphological characteristics and RAPD markers. 1thNational Electronic Conference on New Topics in Gardening Science, Jahrom University of Agricultural Engineering Association, Jahrom, Iran (In Persian).
4. Bendhifi, M., Baraket, G., Zourgui, L., Souid, S. and Salhi-Hannachi, A. (2013). Assessment of genetic diversity of Tunisian Barbary fig (Opuntia ficus indica) cultivars by RAPD markers and morphological traits. Scientia Horticulturae, 158: 1-7. [DOI:10.1016/j.scienta.2013.04.015]
5. Bihamta, M.R., Naserian-Khiabani, B. and Zamani, M.J. (2009). Molecular Markers in Plant Genetics and Biotechnology. University of Tehran Press (UTP), Tehran, IR (In Persian).
6. Botstein, D., White, R.L., Skolnick M. and Davis, R.W. (1980). Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. American Journal of Human Genetics, 32: 314-331.
7. Cheghamirza, K., Koveza, O., Konovalov, F. and Gostimsky, S. (2002). Identification of RAPD markers and their use for molecular mapping in pea (Pisum sativum L.). Cellular and Molecular Biology Letters, 7: 649-656.
8. Costa, F., Marchese, A., Mafrica, R., Di Vaio, C., Ferrara, G., Fretto, S., Quartararo, A., Marra, F.P., Mennone, C., Vitale, F., Reale, S. and Caruso, T. (2015). Genetic diversity of fig (Ficus carica L.) genotypes grown in southern Italy revealed by the use of SSR markers. Acta Horticulturae, 1173: 75-80. [DOI:10.17660/ActaHortic.2017.1173.13]
9. Doolatian, L., Khodayari, H. and Mohammadi, A. (2017). The genetic diversity survey of the Ficus l. genus in Iran using inter simple sequence repeats markers. Plant Genetic Researches, 4(1): 51-62 (In Persian). [DOI:10.29252/pgr.4.1.51]
10. Essid, A., Aljane, F., Ferchichi, A., and Hormaza, J.I. (2015). Analysis of genetic diversity of Tunisian caprifig (Ficus carica L.) accessions using simple sequence repeat (SSR) markers. Hereditas, 152: 1-7. [DOI:10.1186/s41065-015-0002-9]
11. Ganopoulos, I., Kalivas, A., Kavroulakis, N., Xanthopoulou, A., Mastrogianni, A., Koubouris, G. and Madesis, P. (2015). Genetic diversity of Barbary fig (Opuntia ficus-indica) collection in Greece with ISSR molecular markers. Plant Gene, 2: 29-33. [DOI:10.1016/j.plgene.2015.04.001]
12. Ghorbani, T., Cheghamirza, K. and Arji, E. (2013). Evaluation of genetic diversity in pomegranate using morphological traits and molecular markers. Journal of Agricultural Biotechnology, 5: 111-127 (In Persian).
13. Ikegami, H., Nogata, H., Hirashima, K., Awamura, M. and Nakahara, T. (2009). Analysis of genetic diversity among European and Asian fig varieties (Ficus carica L.) using ISSR, RAPD, and SSR markers. Genetic Resources and Crop Evolution, 56: 201-209. [DOI:10.1007/s10722-008-9355-5]
14. Jafari, N., Naderi, P. and Ebrahimzadeh, M.A. (2015). Evaluation of phenolic content, total flavonoid and survey of antioxidant activity of leaves of Ficus carica and Pterocarya fraxinifolia trees using spectrophotometry and high performance liquid chromatograph methods. Iranian Journal of Plant Biology, 7: 1-16 (In Persian).
15. Karimi Shahri, M.R., Dehvari, V., Hajian Shahri, M. and Mokhtarian, A. (2011). Genetic diversity of some grapevine cultivars of Khorasan Razavi province based on RAPD and ISSR markers. Journal of Seed and Plant Improvement, 28: 159- 172 (In Persian).
16. Mahdavian, M., Lessani, H., Ebadi, A. and Fatah, R. (2008). Morphological study of genetic variation among Iranian figs (Ficus carica L.) cultivars. Pajouhesh & Sazandegi, 80: 144-158 (In Persian).
17. MirMohammadi Maibody, S.A.M. and Golkar, P. (2019). Application of DNA molecular markers in plant breeding. Plant Genetic Researches, 6(1): 1-30 (In Persian). [DOI:10.29252/pgr.6.1.1]
18. Murray, M.G. and Thompson, W.F. (1980). Rapid isolation of high molecular weight plant DNA. Nucleic Acids Research, 8: 4321-4326. [DOI:10.1093/nar/8.19.4321]
19. Nei, M. (1973). Analysis of gene diversity in subdivided populations. Proceedings of the National Academy of Sciences, 70: 3321-3323. [DOI:10.1073/pnas.70.12.3321]
20. Rashidi, A. and Noureddini, M. (2011). Hypoglycemic effect of the aromatic water of leaves of Ficus carica in normal and streptozotocin induced diabetic rats. Pharmacologyonline, 1: 372-379.
21. Saleh, B. (2013). Genetic diversity in Ficus sycomorus L. species (Moraceae) using RAPD and IRAP markers. Agriculture, 59: 120-130. [DOI:10.2478/agri-2013-0011]
22. Salhi-Hannachi, A.M.E.L., Chatti, K., Saddoud, O., Mars, M., Rhouma, A., Marrakchi, M. and Trifi, M. (2006). Genetic diversity of different Tunisian fig (Ficus carica L.) collections revealed by RAPD fingerprints. Hereditas, 143: 15-22. [DOI:10.1111/j.2005.0018-0661.01904.x]
23. Teoman, S., Meryem, I.P.E.K., Erturk, U., Tangu, N.A., Durgut, E., Barut, E., Ercisli, S. and Ipek, A. (2017). Assessment of genetic relationship among male and female fig genotypes using simple sequence repeat (SSR) markers. Notulae Botanicae Horti Agrobotanici Cluj-Napoca, 45: 172-178. [DOI:10.15835/nbha45110756]
24. Zhang, P., Dreisigacker, S., Buerkert, A., Alkhanjari, S., Melchinger, A.E. and Warburton, M. L. (2006). Genetic diversity and relationships of wheat landraces from Oman investigated with SSR markers. Genetic Resources and Crop Evolution, 53: 1351-1360. [DOI:10.1007/s10722-005-4675-1]
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Gheitarani B, Erfani-Moghadam J, Fazeli A. Evaluation of Genetic Diversity among Some Common Fig Using RAPD and ISSR Molecular Markers. pgr 2020; 6 (2) :43-54
URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-146-fa.html

قیطرانی بتول، عرفانی مقدم جواد، فاضلی آرش. ارزیابی تنوع ژنتیکی برخی از ژنوتیپ‌های انجیر با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD و ISSR. پژوهش های ژنتیک گیاهی. 1398; 6 (2) :43-54

URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-146-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 6، شماره 2 - ( 1398 ) برگشت به فهرست نسخه ها
پژوهش های ژنتیک گیاهی Plant Genetic Researches
Persian site map - English site map - Created in 0.07 seconds with 41 queries by YEKTAWEB 4642